2013年10月16日，教育部、财政部组织的首批“2011协同创新中心”工作推进与实地考察会议在北京交通大学召开，教育部副部长杜占元、科技司司长王延觉、财务司副司长胡延品、规划司副司长张泰青、财政部教科文司副处长吴海峰等出席会议，会议由教育部科技司司长王延觉主持。校党委书记王德明、副校长乔旭等参加会议。

王延觉司长做了《关于做好“2011协同创新中心”绩效管理的思路和要求》的报告，分别就绩效管理的基本思路、基本原则、基本要点、基本办法等方面做了深入解读。王司长特别强调，国家级协同创新中心认定满四年后，由教育部、财政部组织实施第三方评估，广泛吸纳国内外的同行专家参与评估，对于评估优秀的中心将给予奖励性支持；对于已经完成重大协同创新任务、能够自我良性发展的中心，将给予“毕业”，支持其稳定发展；对于建设效果一般、无法完成预期创新和改革指标的中心，将予以淘汰。

杜占元副部长在讲话中首先对前一阶段的工作做了总结，并对今后“2011协同创新中心”的工作提出要求：一是要进一步转变观念，增强实力；二是要实行多元化动态评估，不合格的中心将会被摘牌并取消经费支持；三是要统筹资源利用，严格经费管理，提高经费使用效益；四是要加大体制机制改革力度，落实各项配套政策。杜部长最后强调，协同创新是 “一把手工程”，各牵头单位要加强组织领导，深化协同创新，学校主要领导必须要亲自抓，抓到位，走出校门去协同创新，不能拘泥于现在的形势，要不断引进和探索新的体制机制来推进中心建设发展，真正为国家高等教育改革发展献力。

轨道交通安全协同创新中心主任、北京交通大学余祖俊副校长作为此次会议代表单位从中心建设背景、体制机制改革、现状与成效以及未来四年发展规划等几个方面汇报了该中心工作情况。会后，与会领导参观了北京交通大学轨道交通控制与安全国家重点实验室和轨道交通运行控制系统国家工程研究中心。