1、校长欧阳平凯院士主持的《生物分离工程》课程入选国家精品课程，填补了我校国家精品课程的空白，刷新了我省国家精品课程的学科门类。
2、我院新增发酵工程博士学位授权点；新增药物化学、食品科学硕士学位授权点；新增工程硕士“生物工程”领域授权点；新开“生物技术”、“食品工程”本科特色自考。
3、我院生物化工学科被江苏省列为国家重点学科建设培育点；生物工程专业顺利通过首届省级品牌专业验收。
4、中国石化南京工业生物技术联合研究开发中心成立，掀开了国家生化工程技术研究中心新的篇章。 同凯兆业、南京汇科、新凯龙、爱富生等公司落户国家生化工程技术研究中心。
5、欧阳平凯院士当选中国石化协会副会长、江苏省科学技术协会副主席；英国化学工程师协会特邀欧阳平凯院士为荣誉会员；曹竹安、林章凛、黄日波、马延和等四位在生物工程与生命科学界学术造诣深厚、成果丰硕、享有盛誉的著名学者，应学科首席教授欧阳平凯院士聘请，出任我院生物化工国家重点学科特聘兼职教授;国际著名生物化工专家曹祖宁先生荣膺我校荣誉教授称号;胡永红、黄和、熊晓辉晋升教授。
6、欧阳平凯院士主持的国家973计划项目通过中期鉴定；应汉杰、徐虹、韦萍教授分别主持的三项国家“十五”攻关计划项目通过验收；韦萍教授、张琪讲师申报的项目获得国家自然科学基金资助；沈树宝教授主持完成的“膜生物反应器处理PTA废水的高效组合工艺”以 国内领先水平通过鉴定，其中以固定化高效降解菌的膜生物反应器处理PTA废水达到国际先进水平；李莎同学的作品《新型驱油剂－威兰胶制备新工艺》获第九届“挑战杯”全国大学生课外学术科技作品竞赛科技发明类二等奖，徐元龙同学的作品《莪术油固体脂质纳米粒的制备与研究》获第九届“挑战杯”全国大学生课外学术科技作品竞赛自然科学类学术论文二等奖。两件作品分别由徐虹教授、李学明副教授指导。
7、我院党建工作顺利通过了江苏省高校党建工作评估专家组的验收；保持共产党员先进性教育活动取得成效；学院党委被评为校“先进基层党委”；教工第一党支部被评为校“先进党支部”；范伟平被评为校“优秀共产党员”；缪昌美获中央国家机关工委“党的先进性建设”征文二等奖。
8、我院“生物工程与技术基础实验和工程实训中心”被江苏省教育厅列为江苏省高等学校基础课实验教学示范中心建设点。常务副院长韦萍教授负责的“创新型生物工程实践教学体系的建立及实施”课题，入选2005年江苏省高等教育教学改革研究立项课题。
9、我院博士生导师徐虹教授荣获第八届“江苏省青年科技奖”；副院长周华副教授入选江苏省“青蓝工程”优秀青年骨干教师培养计划；副书记何学军被评为江苏高校思想政治教育工作先进个人。学生工作办公室被评为校“教书育人先进集体”；范伟平、韦萍被评为校“教书育人先进个人”；曹飞荣获“工大集团奖教金”。
10、我院教职工以“激情工作、健康生活”的理念和团结拼搏的精神，赢得第三届校运会教工组团体总分第二名、第四届教工乒乓球比赛男子组第二名和女子组第六名、第二届教职工游泳比赛团体总分第五名的好成绩，刷新学院记录。