生物与制药工程学院是中国生物化工学科的诞生地之一，是我国生物制造领域中最具品牌影响力和竞争力的高等教育基地之一，入选“全国党建工作标杆院系”，是国家生化工程技术研究中心、材料化学工程国家重点实验室、江苏先进生物与化学制造国家级协同创新中心、生物化学工程国家级实验教学示范中心、江苏省合成生物基础研究中心等国家和省部级教学科研平台的依托单位。生物工程和制药工程2个专业均入选首批国家一流本科专业，且全部通过华盛顿协议工程教育专业认证，现有本科生1400余人，硕博士研究生1100余人。

学院师资队伍力量雄厚。学院集聚了一批学术造诣深厚、科研成果卓著的师资队伍，2000年以来先后有3位教师入选中国工程院院士。现有教职工157名，其中中国工程院院士1名，国家级高层次人才16人次，教育部创新团队1个，省部级高层次人才53人次，正高级职称人员46名，副高级职称人员43名，博士生导师27名，硕士生导师56名。

学院学科建设实力强劲。学院现设有江苏省唯一的生物工程一级学科博士学位授权点，共建有材料与化工专业学位博士授权点，以及生物化工、制药工程与技术、化学工程与工艺等三个二级学科博士学位授权点，生物学一级学科硕士学位授权点，生物与医药专业学位硕士授权点。生物化工学科是国家重点学科和教育部国家特色重点学科，学院主体学科持续获得江苏高校优势学科建设工程资助，生物学与生物化学学科稳居ESI全球前1%，另外还同时支撑了化学、材料科学2个学科进入ESI全球前1‰，工程学、环境科学与生态学、农业科学等3个学科进入ESI全球前1%。

学院人才培养体系健全。现已形成生物催化与转化工程、合成生物技术与系统生物工程、生物高分子材料工程、制药与食品生物工程、生物资源与环境工程、生物检测技术与安全评价等6大国内领先且具有特色优势的人才培养方向。拥有国家级教学团队1个，国家级教学资源6项，获国家级教学成果二等奖2项等。近五年学生获国家级“互联网+”、“挑战杯”、国际基因工程机器大赛（iGEM）、全国大学生生命科学竞赛等国内国际大学生创新创业竞赛奖励20余项。在长三角地区建有稳固的校友企业及产学研合作“朋友圈”。

学院科学研究业绩突出。学院秉承创始人欧阳平凯院士“顶天立地”的发展理念，瞄准学科世界前沿、国家战略需求以及区域经济发展需要，坚持产学研用结合，走优势与特色发展之路。先后主持973计划项目2项、国家重点研发计划项目2项、国家自然科学基金委重大项目1项，累计承担973、863、国家科技支撑计划、国家重点研发计划、国家自然科学基金在内的各级各类课题近300项，年科研经费7000多万元，人年均科研经费超过50万元。

学院服务社会能力卓越。学院坚持开展有组织科研，深耕绿色生物制造、合成生物学、生物医药制造等领域，前瞻性发展绿色“碳中和”与“大健康”生物医药产业，获包括国家科技进步一等奖在内的国家科技奖励7项。近年来新建江苏省产业技术研究院工业生物技术研究所、南京先进生物材料与过程装备研究院等新型研发机构，并与中石化、中粮、泸州老窖等大型国企开展合作，衍生孵化了30余家科技型企业，成为持续引领国家生物工程学科教育、科技与人才全面发展的战略高地。